Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms