Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUDCD1Q96RS6 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms