Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQN7

SLCO4C1, Solute carrier organic anion transporter family member 4C1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO4C1Q6ZQN7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLCO4C1Q6ZQN7 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLCO4C1Q6ZQN7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLCO4C1Q6ZQN7 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLCO4C1Q6ZQN7 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLCO4C1Q6ZQN7 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLCO4C1Q6ZQN7 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLCO4C1Q6ZQN7 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLCO4C1Q6ZQN7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLCO4C1Q6ZQN7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLCO4C1Q6ZQN7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SLCO4C1Q6ZQN7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLCO4C1Q6ZQN7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SLCO4C1Q6ZQN7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLCO4C1Q6ZQN7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLCO4C1Q6ZQN7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLCO4C1Q6ZQN7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLCO4C1Q6ZQN7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLCO4C1Q6ZQN7 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLCO4C1Q6ZQN7 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLCO4C1Q6ZQN7 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLCO4C1Q6ZQN7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLCO4C1Q6ZQN7 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLCO4C1Q6ZQN7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLCO4C1Q6ZQN7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLCO4C1Q6ZQN7 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLCO4C1Q6ZQN7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLCO4C1Q6ZQN7 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLCO4C1Q6ZQN7 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLCO4C1Q6ZQN7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLCO4C1Q6ZQN7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLCO4C1Q6ZQN7 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLCO4C1Q6ZQN7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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