Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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CASC2Q6XLA1 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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CASC2Q6XLA1 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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