Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms