Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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