Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms