Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms