Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 LRRIQ3-203ENST00000370911 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 PAICSP2-201ENST00000429118 1150 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 AC073115.1-201ENST00000436056 532 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 AL356019.1-201ENST00000553419 748 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 AC010618.2-201ENST00000596192 460 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms