Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD4AQ9UPU9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms