Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
INO80Q9ULG1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms