Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.3■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.29■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.28■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.28■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.28■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.27■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.27■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.27■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms