Protein–RNA interactions for Protein: Q499Y3

Putative uncharacterized protein C10orf88-like, humanhuman

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Length 187 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q499Y3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q499Y3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q499Y3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q499Y3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q499Y3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q499Y3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q499Y3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q499Y3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q499Y3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q499Y3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q499Y3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q499Y3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q499Y3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q499Y3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q499Y3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q499Y3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q499Y3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q499Y3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q499Y3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q499Y3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q499Y3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q499Y3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q499Y3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q499Y3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q499Y3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q499Y3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q499Y3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q499Y3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q499Y3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q499Y3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q499Y3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q499Y3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q499Y3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q499Y3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q499Y3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q499Y3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q499Y3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q499Y3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q499Y3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q499Y3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q499Y3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q499Y3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q499Y3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q499Y3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q499Y3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q499Y3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q499Y3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q499Y3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q499Y3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q499Y3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q499Y3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q499Y3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q499Y3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q499Y3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q499Y3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q499Y3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q499Y3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q499Y3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q499Y3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q499Y3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q499Y3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q499Y3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q499Y3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q499Y3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q499Y3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q499Y3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q499Y3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q499Y3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q499Y3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q499Y3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q499Y3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q499Y3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q499Y3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q499Y3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q499Y3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q499Y3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q499Y3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q499Y3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q499Y3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q499Y3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q499Y3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q499Y3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q499Y3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q499Y3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q499Y3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q499Y3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q499Y3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q499Y3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q499Y3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q499Y3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q499Y3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q499Y3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q499Y3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q499Y3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q499Y3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q499Y3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q499Y3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q499Y3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q499Y3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q499Y3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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