Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
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PTPRSQ13332 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
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PTPRSQ13332 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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PTPRSQ13332 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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PTPRSQ13332 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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PTPRSQ13332 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
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PTPRSQ13332 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRSQ13332 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
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