Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CD164Q04900 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CD164Q04900 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
CD164Q04900 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CD164Q04900 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CD164Q04900 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CD164Q04900 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CD164Q04900 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CD164Q04900 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CD164Q04900 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
CD164Q04900 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CD164Q04900 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CD164Q04900 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CD164Q04900 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CD164Q04900 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CD164Q04900 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CD164Q04900 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CD164Q04900 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CD164Q04900 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CD164Q04900 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CD164Q04900 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CD164Q04900 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CD164Q04900 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CD164Q04900 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CD164Q04900 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CD164Q04900 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CD164Q04900 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CD164Q04900 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CD164Q04900 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CD164Q04900 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CD164Q04900 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CD164Q04900 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CD164Q04900 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CD164Q04900 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CD164Q04900 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CD164Q04900 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CD164Q04900 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CD164Q04900 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CD164Q04900 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CD164Q04900 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CD164Q04900 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CD164Q04900 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CD164Q04900 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CD164Q04900 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CD164Q04900 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CD164Q04900 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CD164Q04900 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CD164Q04900 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CD164Q04900 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CD164Q04900 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CD164Q04900 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CD164Q04900 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CD164Q04900 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CD164Q04900 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CD164Q04900 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CD164Q04900 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CD164Q04900 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CD164Q04900 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CD164Q04900 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CD164Q04900 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CD164Q04900 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
CD164Q04900 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
CD164Q04900 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CD164Q04900 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CD164Q04900 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CD164Q04900 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CD164Q04900 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CD164Q04900 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CD164Q04900 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CD164Q04900 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CD164Q04900 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CD164Q04900 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CD164Q04900 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CD164Q04900 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CD164Q04900 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CD164Q04900 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CD164Q04900 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CD164Q04900 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CD164Q04900 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CD164Q04900 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CD164Q04900 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CD164Q04900 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CD164Q04900 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CD164Q04900 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CD164Q04900 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CD164Q04900 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CD164Q04900 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CD164Q04900 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CD164Q04900 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CD164Q04900 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CD164Q04900 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CD164Q04900 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CD164Q04900 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CD164Q04900 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CD164Q04900 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CD164Q04900 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CD164Q04900 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CD164Q04900 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CD164Q04900 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CD164Q04900 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms