Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms