Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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