Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms