Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms