Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP13Q86W25 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP13Q86W25 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP13Q86W25 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP13Q86W25 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP13Q86W25 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP13Q86W25 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP13Q86W25 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP13Q86W25 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP13Q86W25 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP13Q86W25 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP13Q86W25 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP13Q86W25 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP13Q86W25 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP13Q86W25 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP13Q86W25 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP13Q86W25 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP13Q86W25 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP13Q86W25 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP13Q86W25 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP13Q86W25 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP13Q86W25 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP13Q86W25 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP13Q86W25 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP13Q86W25 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP13Q86W25 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP13Q86W25 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP13Q86W25 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP13Q86W25 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP13Q86W25 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP13Q86W25 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP13Q86W25 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP13Q86W25 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP13Q86W25 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP13Q86W25 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP13Q86W25 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP13Q86W25 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP13Q86W25 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP13Q86W25 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP13Q86W25 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP13Q86W25 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP13Q86W25 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP13Q86W25 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP13Q86W25 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP13Q86W25 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP13Q86W25 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP13Q86W25 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP13Q86W25 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP13Q86W25 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP13Q86W25 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms