Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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