Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms