Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms