Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms