Protein–RNA interactions for Protein: P16871

IL7R, Interleukin-7 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL7RP16871 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IL7RP16871 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IL7RP16871 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IL7RP16871 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IL7RP16871 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IL7RP16871 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IL7RP16871 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IL7RP16871 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IL7RP16871 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IL7RP16871 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IL7RP16871 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IL7RP16871 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IL7RP16871 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
IL7RP16871 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
IL7RP16871 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
IL7RP16871 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IL7RP16871 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IL7RP16871 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IL7RP16871 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
IL7RP16871 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IL7RP16871 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IL7RP16871 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
IL7RP16871 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IL7RP16871 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IL7RP16871 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IL7RP16871 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IL7RP16871 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IL7RP16871 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IL7RP16871 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IL7RP16871 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IL7RP16871 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IL7RP16871 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IL7RP16871 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IL7RP16871 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IL7RP16871 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL7RP16871 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL7RP16871 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL7RP16871 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL7RP16871 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL7RP16871 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL7RP16871 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL7RP16871 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
IL7RP16871 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL7RP16871 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL7RP16871 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL7RP16871 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL7RP16871 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL7RP16871 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL7RP16871 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
IL7RP16871 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
IL7RP16871 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
IL7RP16871 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL7RP16871 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL7RP16871 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
IL7RP16871 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL7RP16871 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL7RP16871 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL7RP16871 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL7RP16871 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL7RP16871 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL7RP16871 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL7RP16871 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL7RP16871 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL7RP16871 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL7RP16871 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL7RP16871 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL7RP16871 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL7RP16871 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL7RP16871 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL7RP16871 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL7RP16871 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL7RP16871 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL7RP16871 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL7RP16871 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL7RP16871 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL7RP16871 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL7RP16871 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL7RP16871 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL7RP16871 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL7RP16871 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL7RP16871 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IL7RP16871 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL7RP16871 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL7RP16871 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL7RP16871 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL7RP16871 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL7RP16871 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL7RP16871 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL7RP16871 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL7RP16871 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL7RP16871 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL7RP16871 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL7RP16871 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL7RP16871 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL7RP16871 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL7RP16871 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL7RP16871 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL7RP16871 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL7RP16871 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL7RP16871 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms