Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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HOXA3O43365 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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HOXA3O43365 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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HOXA3O43365 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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HOXA3O43365 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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HOXA3O43365 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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HOXA3O43365 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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