Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI0

ATAD2B, ATPase family AAA domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD2BQ9ULI0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ATAD2BQ9ULI0 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ATAD2BQ9ULI0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ATAD2BQ9ULI0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ATAD2BQ9ULI0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ATAD2BQ9ULI0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ATAD2BQ9ULI0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ATAD2BQ9ULI0 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ATAD2BQ9ULI0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ATAD2BQ9ULI0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ATAD2BQ9ULI0 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ATAD2BQ9ULI0 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ATAD2BQ9ULI0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ATAD2BQ9ULI0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ATAD2BQ9ULI0 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ATAD2BQ9ULI0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ATAD2BQ9ULI0 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ATAD2BQ9ULI0 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ATAD2BQ9ULI0 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ATAD2BQ9ULI0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ATAD2BQ9ULI0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ATAD2BQ9ULI0 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
ATAD2BQ9ULI0 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
ATAD2BQ9ULI0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
ATAD2BQ9ULI0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
ATAD2BQ9ULI0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
ATAD2BQ9ULI0 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ATAD2BQ9ULI0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms