Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms