Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 PUM2-206ENST00000424110 546 ntTSL 414.8□□□□□ -0.041e-8■□□□□ 8.6
PUM1Q14671 ILF3-220ENST00000590869 531 ntTSL 514.46□□□□□ -0.091e-8■□□□□ 8.6
PUM1Q14671 FKBP8-210ENST00000599540 1140 ntTSL 213.81□□□□□ -0.21e-8■□□□□ 8.6
PUM1Q14671 ILF3-221ENST00000591649 2579 ntTSL 213.45□□□□□ -0.261e-8■□□□□ 8.6
PUM1Q14671 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.291e-8■□□□□ 8.6
PUM1Q14671 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.372e-12■□□□□ 8.6
PUM1Q14671 FAM177A1-201ENST00000280987 2927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.441e-8■□□□□ 8.6
PUM1Q14671 FAM177A1-203ENST00000396472 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.641e-8■□□□□ 8.6
PUM1Q14671 DDX23-214ENST00000552512 696 ntTSL 410.2□□□□□ -0.782e-12■□□□□ 8.6
PUM1Q14671 NDE1-210ENST00000574163 352 ntTSL 39.91□□□□□ -0.821e-8■□□□□ 8.6
PUM1Q14671 SLC38A2-203ENST00000547252 847 ntTSL 38.43□□□□□ -1.061e-8■□□□□ 8.6
PUM1Q14671 PUM2-210ENST00000442400 955 ntTSL 57.85□□□□□ -1.151e-8■□□□□ 8.6
PUM1Q14671 FAM177A1-210ENST00000555260 912 ntTSL 27.13□□□□□ -1.271e-8■□□□□ 8.6
PUM1Q14671 FAM177A1-208ENST00000554794 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 26.02□□□□□ -1.451e-8■□□□□ 8.6
PUM1Q14671 PUM2-208ENST00000432105 584 ntTSL 54.97□□□□□ -1.611e-8■□□□□ 8.6
PUM1Q14671 PUM2-205ENST00000420234 562 ntTSL 54.59□□□□□ -1.671e-8■□□□□ 8.6
PUM1Q14671 CSDE1-216ENST00000534389 601 ntTSL 43.15□□□□□ -1.911e-8■□□□□ 8.6
PUM1Q14671 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.061e-14■□□□□ 8.6
PUM1Q14671 TRAP1-210ENST00000574494 547 ntTSL 213.01□□□□□ -0.331e-14■□□□□ 8.6
PUM1Q14671 TRAP1-201ENST00000246957 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.451e-14■□□□□ 8.6
PUM1Q14671 TRAP1-212ENST00000575671 2309 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.51e-14■□□□□ 8.6
PUM1Q14671 CROCCP2-201ENST00000362058 2029 ntTSL 223.07■■□□□ 1.286e-12■□□□□ 8.6
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PUM1Q14671 CROCCP2-204ENST00000639456 2575 ntTSL 517.08■□□□□ 0.326e-12■□□□□ 8.6
PUM1Q14671 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.57■□□□□ 0.246e-12■□□□□ 8.6
PUM1Q14671 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.515e-7■□□□□ 8.6
PUM1Q14671 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.45e-7■□□□□ 8.6
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PUM1Q14671 HDGF-205ENST00000469145 844 ntTSL 219.5■□□□□ 0.715e-7■□□□□ 8.6
PUM1Q14671 HDGF-204ENST00000465180 2060 ntTSL 1 (best)14.36□□□□□ -0.115e-7■□□□□ 8.6
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PUM1Q14671 HDGF-208ENST00000482651 966 ntTSL 39.1□□□□□ -0.955e-7■□□□□ 8.6
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PUM1Q14671 RPL19-208ENST00000585199 402 ntTSL 211.67□□□□□ -0.542e-29■□□□□ 8.6
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PUM1Q14671 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.172e-8■□□□□ 8.6
PUM1Q14671 SEPT11-210ENST00000510641 1870 ntTSL 1 (best)16.77■□□□□ 0.274e-17■□□□□ 8.6
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PUM1Q14671 P4HB-211ENST00000477607 1110 ntTSL 1 (best)17.23■□□□□ 0.353e-19■□□□□ 8.6
PUM1Q14671 P4HB-212ENST00000478034 811 ntTSL 216.14■□□□□ 0.173e-19■□□□□ 8.6
PUM1Q14671 DYNC1H1-211ENST00000556791 938 ntTSL 39.96□□□□□ -0.823e-7■□□□□ 8.6
PUM1Q14671 SEPT6-206ENST00000460411 1393 ntTSL 221.48■■□□□ 1.034e-23■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.514e-23■□□□□ 8.5
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PUM1Q14671 SEPT6-208ENST00000481072 836 ntTSL 214.05□□□□□ -0.164e-23■□□□□ 8.5
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PUM1Q14671 SEPT6-203ENST00000354416 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.894e-23■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 NDE1-205ENST00000572756 915 ntTSL 516.63■□□□□ 0.252e-6■□□□□ 8.5
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PUM1Q14671 NDE1-201ENST00000396354 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -12e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 NDE1-202ENST00000396355 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.122e-6■□□□□ 8.5
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PUM1Q14671 HNRNPUL1-209ENST00000595336 393 ntTSL 28.5□□□□□ -1.052e-16■□□□□ 8.5
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PUM1Q14671 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.138e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 C11orf58-202ENST00000524439 405 ntTSL 314.23□□□□□ -0.138e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 C11orf58-203ENST00000524461 2040 ntTSL 23.96□□□□□ -1.788e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 CEBPZ-201ENST00000234170 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.315e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 CEBPZ-203ENST00000489306 611 ntTSL 24.55□□□□□ -1.685e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.321e-8■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.473e-26■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.123e-26■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 EEF1A1-201ENST00000309268 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.663e-26■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 EEF1A1-207ENST00000490569 1802 ntTSL 58.47□□□□□ -1.053e-26■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 EEF1A1-208ENST00000491404 633 ntTSL 36.61□□□□□ -1.353e-26■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.613e-26■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.73e-26■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.666e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.96e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.816e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 AC011448.1-202ENST00000586674 1071 ntTSL 218.79■□□□□ 0.66e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 NDUFA13-205ENST00000511180 593 ntTSL 216.81■□□□□ 0.286e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 NDUFA13-202ENST00000502506 1166 ntTSL 215.7■□□□□ 0.16e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 NDUFA13-207ENST00000606722 502 ntTSL 312.91□□□□□ -0.346e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 NDUFA13-204ENST00000507754 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.426e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.064e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.064e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.734e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 UNC13D-213ENST00000590762 848 ntTSL 524.84■■□□□ 1.574e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 LNPK-203ENST00000409660 2028 ntTSL 1 (best)24.32■■□□□ 1.484e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 UNC13D-211ENST00000588774 938 ntTSL 323.33■■□□□ 1.334e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 SDHA-212ENST00000509632 583 ntTSL 423.04■■□□□ 1.284e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 NSFL1C-209ENST00000489203 694 ntTSL 322.89■■□□□ 1.254e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 MAP2K1-202ENST00000425818 1338 ntTSL 522.85■■□□□ 1.254e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.234e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 NSFL1C-207ENST00000478168 624 ntTSL 222.63■■□□□ 1.214e-6■□□□□ 8.5
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