Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

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Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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