Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms