Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms