Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms