Protein–RNA interactions for Protein: O14817

TSPAN4, Tetraspanin-4, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4O14817 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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TSPAN4O14817 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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TSPAN4O14817 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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TSPAN4O14817 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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TSPAN4O14817 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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TSPAN4O14817 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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TSPAN4O14817 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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TSPAN4O14817 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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