Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPN6Q9Y6Q1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPN6Q9Y6Q1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPN6Q9Y6Q1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPN6Q9Y6Q1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPN6Q9Y6Q1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPN6Q9Y6Q1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPN6Q9Y6Q1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAPN6Q9Y6Q1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAPN6Q9Y6Q1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAPN6Q9Y6Q1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAPN6Q9Y6Q1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAPN6Q9Y6Q1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAPN6Q9Y6Q1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAPN6Q9Y6Q1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAPN6Q9Y6Q1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAPN6Q9Y6Q1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAPN6Q9Y6Q1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CAPN6Q9Y6Q1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPN6Q9Y6Q1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPN6Q9Y6Q1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPN6Q9Y6Q1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPN6Q9Y6Q1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPN6Q9Y6Q1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPN6Q9Y6Q1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPN6Q9Y6Q1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAPN6Q9Y6Q1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAPN6Q9Y6Q1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPN6Q9Y6Q1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPN6Q9Y6Q1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAPN6Q9Y6Q1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAPN6Q9Y6Q1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAPN6Q9Y6Q1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAPN6Q9Y6Q1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAPN6Q9Y6Q1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPN6Q9Y6Q1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPN6Q9Y6Q1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPN6Q9Y6Q1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAPN6Q9Y6Q1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAPN6Q9Y6Q1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAPN6Q9Y6Q1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAPN6Q9Y6Q1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAPN6Q9Y6Q1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAPN6Q9Y6Q1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAPN6Q9Y6Q1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAPN6Q9Y6Q1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CAPN6Q9Y6Q1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAPN6Q9Y6Q1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAPN6Q9Y6Q1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAPN6Q9Y6Q1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAPN6Q9Y6Q1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAPN6Q9Y6Q1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAPN6Q9Y6Q1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAPN6Q9Y6Q1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAPN6Q9Y6Q1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAPN6Q9Y6Q1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAPN6Q9Y6Q1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CAPN6Q9Y6Q1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CAPN6Q9Y6Q1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAPN6Q9Y6Q1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAPN6Q9Y6Q1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAPN6Q9Y6Q1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAPN6Q9Y6Q1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAPN6Q9Y6Q1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAPN6Q9Y6Q1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAPN6Q9Y6Q1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAPN6Q9Y6Q1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAPN6Q9Y6Q1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAPN6Q9Y6Q1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAPN6Q9Y6Q1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAPN6Q9Y6Q1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAPN6Q9Y6Q1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAPN6Q9Y6Q1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAPN6Q9Y6Q1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAPN6Q9Y6Q1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CAPN6Q9Y6Q1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CAPN6Q9Y6Q1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CAPN6Q9Y6Q1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAPN6Q9Y6Q1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAPN6Q9Y6Q1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAPN6Q9Y6Q1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAPN6Q9Y6Q1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAPN6Q9Y6Q1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAPN6Q9Y6Q1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAPN6Q9Y6Q1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAPN6Q9Y6Q1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CAPN6Q9Y6Q1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAPN6Q9Y6Q1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAPN6Q9Y6Q1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAPN6Q9Y6Q1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAPN6Q9Y6Q1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAPN6Q9Y6Q1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAPN6Q9Y6Q1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAPN6Q9Y6Q1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAPN6Q9Y6Q1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CAPN6Q9Y6Q1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAPN6Q9Y6Q1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAPN6Q9Y6Q1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
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