Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y646

CPQ, Carboxypeptidase Q, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPQQ9Y646 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPQQ9Y646 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPQQ9Y646 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPQQ9Y646 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPQQ9Y646 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPQQ9Y646 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CPQQ9Y646 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CPQQ9Y646 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CPQQ9Y646 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CPQQ9Y646 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CPQQ9Y646 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CPQQ9Y646 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPQQ9Y646 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPQQ9Y646 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CPQQ9Y646 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPQQ9Y646 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPQQ9Y646 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPQQ9Y646 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPQQ9Y646 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPQQ9Y646 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPQQ9Y646 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPQQ9Y646 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPQQ9Y646 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPQQ9Y646 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CPQQ9Y646 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CPQQ9Y646 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CPQQ9Y646 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CPQQ9Y646 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CPQQ9Y646 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CPQQ9Y646 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPQQ9Y646 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPQQ9Y646 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPQQ9Y646 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPQQ9Y646 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPQQ9Y646 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPQQ9Y646 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPQQ9Y646 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CPQQ9Y646 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPQQ9Y646 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CPQQ9Y646 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CPQQ9Y646 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPQQ9Y646 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPQQ9Y646 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPQQ9Y646 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPQQ9Y646 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPQQ9Y646 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPQQ9Y646 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPQQ9Y646 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPQQ9Y646 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CPQQ9Y646 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CPQQ9Y646 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CPQQ9Y646 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPQQ9Y646 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPQQ9Y646 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPQQ9Y646 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CPQQ9Y646 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPQQ9Y646 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPQQ9Y646 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPQQ9Y646 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPQQ9Y646 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPQQ9Y646 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPQQ9Y646 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPQQ9Y646 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CPQQ9Y646 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPQQ9Y646 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPQQ9Y646 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPQQ9Y646 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPQQ9Y646 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPQQ9Y646 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPQQ9Y646 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPQQ9Y646 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPQQ9Y646 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPQQ9Y646 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPQQ9Y646 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CPQQ9Y646 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPQQ9Y646 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPQQ9Y646 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPQQ9Y646 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPQQ9Y646 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPQQ9Y646 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPQQ9Y646 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPQQ9Y646 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CPQQ9Y646 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CPQQ9Y646 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPQQ9Y646 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPQQ9Y646 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPQQ9Y646 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPQQ9Y646 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPQQ9Y646 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPQQ9Y646 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPQQ9Y646 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CPQQ9Y646 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CPQQ9Y646 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPQQ9Y646 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPQQ9Y646 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPQQ9Y646 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPQQ9Y646 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPQQ9Y646 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CPQQ9Y646 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPQQ9Y646 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms