Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G0

PCDHGB5, Protocadherin gamma-B5, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGB5Q9Y5G0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCDHGB5Q9Y5G0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCDHGB5Q9Y5G0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDHGB5Q9Y5G0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDHGB5Q9Y5G0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDHGB5Q9Y5G0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCDHGB5Q9Y5G0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PCDHGB5Q9Y5G0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCDHGB5Q9Y5G0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCDHGB5Q9Y5G0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCDHGB5Q9Y5G0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCDHGB5Q9Y5G0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCDHGB5Q9Y5G0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHGB5Q9Y5G0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHGB5Q9Y5G0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHGB5Q9Y5G0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHGB5Q9Y5G0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHGB5Q9Y5G0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHGB5Q9Y5G0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHGB5Q9Y5G0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHGB5Q9Y5G0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHGB5Q9Y5G0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHGB5Q9Y5G0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHGB5Q9Y5G0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHGB5Q9Y5G0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHGB5Q9Y5G0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHGB5Q9Y5G0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHGB5Q9Y5G0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHGB5Q9Y5G0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHGB5Q9Y5G0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHGB5Q9Y5G0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHGB5Q9Y5G0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHGB5Q9Y5G0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHGB5Q9Y5G0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHGB5Q9Y5G0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHGB5Q9Y5G0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHGB5Q9Y5G0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHGB5Q9Y5G0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHGB5Q9Y5G0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHGB5Q9Y5G0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHGB5Q9Y5G0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHGB5Q9Y5G0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHGB5Q9Y5G0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHGB5Q9Y5G0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHGB5Q9Y5G0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHGB5Q9Y5G0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHGB5Q9Y5G0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHGB5Q9Y5G0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCDHGB5Q9Y5G0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCDHGB5Q9Y5G0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCDHGB5Q9Y5G0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDHGB5Q9Y5G0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDHGB5Q9Y5G0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHGB5Q9Y5G0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHGB5Q9Y5G0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHGB5Q9Y5G0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHGB5Q9Y5G0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHGB5Q9Y5G0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHGB5Q9Y5G0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHGB5Q9Y5G0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHGB5Q9Y5G0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHGB5Q9Y5G0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHGB5Q9Y5G0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHGB5Q9Y5G0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHGB5Q9Y5G0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHGB5Q9Y5G0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHGB5Q9Y5G0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDHGB5Q9Y5G0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDHGB5Q9Y5G0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDHGB5Q9Y5G0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDHGB5Q9Y5G0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDHGB5Q9Y5G0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDHGB5Q9Y5G0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHGB5Q9Y5G0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHGB5Q9Y5G0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHGB5Q9Y5G0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHGB5Q9Y5G0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHGB5Q9Y5G0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDHGB5Q9Y5G0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDHGB5Q9Y5G0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDHGB5Q9Y5G0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDHGB5Q9Y5G0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDHGB5Q9Y5G0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDHGB5Q9Y5G0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHGB5Q9Y5G0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHGB5Q9Y5G0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHGB5Q9Y5G0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHGB5Q9Y5G0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHGB5Q9Y5G0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHGB5Q9Y5G0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHGB5Q9Y5G0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHGB5Q9Y5G0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHGB5Q9Y5G0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHGB5Q9Y5G0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHGB5Q9Y5G0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHGB5Q9Y5G0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHGB5Q9Y5G0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHGB5Q9Y5G0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHGB5Q9Y5G0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHGB5Q9Y5G0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms