Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q3

TMED3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED3Q9Y3Q3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMED3Q9Y3Q3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMED3Q9Y3Q3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMED3Q9Y3Q3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMED3Q9Y3Q3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMED3Q9Y3Q3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMED3Q9Y3Q3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMED3Q9Y3Q3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMED3Q9Y3Q3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMED3Q9Y3Q3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMED3Q9Y3Q3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMED3Q9Y3Q3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMED3Q9Y3Q3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TMED3Q9Y3Q3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMED3Q9Y3Q3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMED3Q9Y3Q3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMED3Q9Y3Q3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TMED3Q9Y3Q3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMED3Q9Y3Q3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMED3Q9Y3Q3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMED3Q9Y3Q3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMED3Q9Y3Q3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TMED3Q9Y3Q3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMED3Q9Y3Q3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMED3Q9Y3Q3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMED3Q9Y3Q3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMED3Q9Y3Q3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMED3Q9Y3Q3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TMED3Q9Y3Q3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMED3Q9Y3Q3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMED3Q9Y3Q3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMED3Q9Y3Q3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMED3Q9Y3Q3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMED3Q9Y3Q3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMED3Q9Y3Q3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMED3Q9Y3Q3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMED3Q9Y3Q3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMED3Q9Y3Q3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMED3Q9Y3Q3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TMED3Q9Y3Q3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TMED3Q9Y3Q3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMED3Q9Y3Q3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMED3Q9Y3Q3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMED3Q9Y3Q3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMED3Q9Y3Q3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMED3Q9Y3Q3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMED3Q9Y3Q3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMED3Q9Y3Q3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMED3Q9Y3Q3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMED3Q9Y3Q3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMED3Q9Y3Q3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMED3Q9Y3Q3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMED3Q9Y3Q3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMED3Q9Y3Q3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMED3Q9Y3Q3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMED3Q9Y3Q3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMED3Q9Y3Q3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMED3Q9Y3Q3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TMED3Q9Y3Q3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMED3Q9Y3Q3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMED3Q9Y3Q3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED3Q9Y3Q3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED3Q9Y3Q3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED3Q9Y3Q3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED3Q9Y3Q3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED3Q9Y3Q3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED3Q9Y3Q3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED3Q9Y3Q3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED3Q9Y3Q3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMED3Q9Y3Q3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMED3Q9Y3Q3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMED3Q9Y3Q3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMED3Q9Y3Q3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMED3Q9Y3Q3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
TMED3Q9Y3Q3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TMED3Q9Y3Q3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TMED3Q9Y3Q3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TMED3Q9Y3Q3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMED3Q9Y3Q3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMED3Q9Y3Q3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMED3Q9Y3Q3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMED3Q9Y3Q3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMED3Q9Y3Q3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMED3Q9Y3Q3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMED3Q9Y3Q3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMED3Q9Y3Q3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMED3Q9Y3Q3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMED3Q9Y3Q3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED3Q9Y3Q3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED3Q9Y3Q3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED3Q9Y3Q3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED3Q9Y3Q3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED3Q9Y3Q3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED3Q9Y3Q3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED3Q9Y3Q3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED3Q9Y3Q3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED3Q9Y3Q3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED3Q9Y3Q3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED3Q9Y3Q3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED3Q9Y3Q3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms