Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G0

EFR3B, Protein EFR3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3BQ9Y2G0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EFR3BQ9Y2G0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
EFR3BQ9Y2G0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EFR3BQ9Y2G0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
EFR3BQ9Y2G0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
EFR3BQ9Y2G0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EFR3BQ9Y2G0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EFR3BQ9Y2G0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EFR3BQ9Y2G0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EFR3BQ9Y2G0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EFR3BQ9Y2G0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
EFR3BQ9Y2G0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EFR3BQ9Y2G0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EFR3BQ9Y2G0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EFR3BQ9Y2G0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EFR3BQ9Y2G0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EFR3BQ9Y2G0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EFR3BQ9Y2G0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
EFR3BQ9Y2G0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
EFR3BQ9Y2G0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EFR3BQ9Y2G0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EFR3BQ9Y2G0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EFR3BQ9Y2G0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EFR3BQ9Y2G0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EFR3BQ9Y2G0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EFR3BQ9Y2G0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EFR3BQ9Y2G0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EFR3BQ9Y2G0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EFR3BQ9Y2G0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EFR3BQ9Y2G0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
EFR3BQ9Y2G0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EFR3BQ9Y2G0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EFR3BQ9Y2G0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EFR3BQ9Y2G0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EFR3BQ9Y2G0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EFR3BQ9Y2G0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EFR3BQ9Y2G0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EFR3BQ9Y2G0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EFR3BQ9Y2G0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
EFR3BQ9Y2G0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
EFR3BQ9Y2G0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
EFR3BQ9Y2G0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
EFR3BQ9Y2G0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
EFR3BQ9Y2G0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
EFR3BQ9Y2G0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
EFR3BQ9Y2G0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
EFR3BQ9Y2G0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
EFR3BQ9Y2G0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EFR3BQ9Y2G0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EFR3BQ9Y2G0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EFR3BQ9Y2G0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EFR3BQ9Y2G0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EFR3BQ9Y2G0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EFR3BQ9Y2G0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EFR3BQ9Y2G0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EFR3BQ9Y2G0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EFR3BQ9Y2G0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
EFR3BQ9Y2G0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EFR3BQ9Y2G0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EFR3BQ9Y2G0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EFR3BQ9Y2G0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EFR3BQ9Y2G0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EFR3BQ9Y2G0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EFR3BQ9Y2G0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EFR3BQ9Y2G0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EFR3BQ9Y2G0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EFR3BQ9Y2G0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EFR3BQ9Y2G0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EFR3BQ9Y2G0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EFR3BQ9Y2G0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EFR3BQ9Y2G0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EFR3BQ9Y2G0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
EFR3BQ9Y2G0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EFR3BQ9Y2G0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EFR3BQ9Y2G0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EFR3BQ9Y2G0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EFR3BQ9Y2G0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EFR3BQ9Y2G0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EFR3BQ9Y2G0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EFR3BQ9Y2G0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EFR3BQ9Y2G0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EFR3BQ9Y2G0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EFR3BQ9Y2G0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EFR3BQ9Y2G0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EFR3BQ9Y2G0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EFR3BQ9Y2G0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EFR3BQ9Y2G0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
EFR3BQ9Y2G0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
EFR3BQ9Y2G0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
EFR3BQ9Y2G0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EFR3BQ9Y2G0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EFR3BQ9Y2G0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EFR3BQ9Y2G0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EFR3BQ9Y2G0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EFR3BQ9Y2G0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EFR3BQ9Y2G0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EFR3BQ9Y2G0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EFR3BQ9Y2G0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EFR3BQ9Y2G0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EFR3BQ9Y2G0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms