Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMG5Q9UPR3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMG5Q9UPR3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMG5Q9UPR3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMG5Q9UPR3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMG5Q9UPR3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMG5Q9UPR3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMG5Q9UPR3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMG5Q9UPR3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMG5Q9UPR3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMG5Q9UPR3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMG5Q9UPR3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMG5Q9UPR3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMG5Q9UPR3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMG5Q9UPR3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMG5Q9UPR3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMG5Q9UPR3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SMG5Q9UPR3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SMG5Q9UPR3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMG5Q9UPR3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SMG5Q9UPR3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SMG5Q9UPR3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SMG5Q9UPR3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMG5Q9UPR3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMG5Q9UPR3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SMG5Q9UPR3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMG5Q9UPR3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMG5Q9UPR3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMG5Q9UPR3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SMG5Q9UPR3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMG5Q9UPR3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMG5Q9UPR3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMG5Q9UPR3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMG5Q9UPR3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SMG5Q9UPR3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMG5Q9UPR3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMG5Q9UPR3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMG5Q9UPR3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMG5Q9UPR3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMG5Q9UPR3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMG5Q9UPR3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMG5Q9UPR3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMG5Q9UPR3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMG5Q9UPR3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMG5Q9UPR3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SMG5Q9UPR3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SMG5Q9UPR3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SMG5Q9UPR3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMG5Q9UPR3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMG5Q9UPR3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMG5Q9UPR3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMG5Q9UPR3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMG5Q9UPR3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMG5Q9UPR3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SMG5Q9UPR3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMG5Q9UPR3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMG5Q9UPR3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMG5Q9UPR3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMG5Q9UPR3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMG5Q9UPR3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMG5Q9UPR3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMG5Q9UPR3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SMG5Q9UPR3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMG5Q9UPR3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMG5Q9UPR3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMG5Q9UPR3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMG5Q9UPR3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMG5Q9UPR3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMG5Q9UPR3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMG5Q9UPR3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMG5Q9UPR3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMG5Q9UPR3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMG5Q9UPR3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMG5Q9UPR3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMG5Q9UPR3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMG5Q9UPR3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMG5Q9UPR3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMG5Q9UPR3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SMG5Q9UPR3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMG5Q9UPR3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMG5Q9UPR3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMG5Q9UPR3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMG5Q9UPR3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMG5Q9UPR3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMG5Q9UPR3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMG5Q9UPR3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMG5Q9UPR3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMG5Q9UPR3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMG5Q9UPR3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMG5Q9UPR3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMG5Q9UPR3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMG5Q9UPR3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMG5Q9UPR3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMG5Q9UPR3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMG5Q9UPR3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SMG5Q9UPR3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMG5Q9UPR3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMG5Q9UPR3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMG5Q9UPR3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMG5Q9UPR3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms