Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULX5

RNF112, RING finger protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF112Q9ULX5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF112Q9ULX5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF112Q9ULX5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF112Q9ULX5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF112Q9ULX5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF112Q9ULX5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF112Q9ULX5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF112Q9ULX5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF112Q9ULX5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF112Q9ULX5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF112Q9ULX5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF112Q9ULX5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF112Q9ULX5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF112Q9ULX5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF112Q9ULX5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF112Q9ULX5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF112Q9ULX5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF112Q9ULX5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF112Q9ULX5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF112Q9ULX5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF112Q9ULX5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF112Q9ULX5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF112Q9ULX5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF112Q9ULX5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF112Q9ULX5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF112Q9ULX5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF112Q9ULX5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF112Q9ULX5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF112Q9ULX5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF112Q9ULX5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF112Q9ULX5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF112Q9ULX5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF112Q9ULX5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF112Q9ULX5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF112Q9ULX5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF112Q9ULX5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF112Q9ULX5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF112Q9ULX5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF112Q9ULX5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF112Q9ULX5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF112Q9ULX5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF112Q9ULX5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF112Q9ULX5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF112Q9ULX5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF112Q9ULX5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF112Q9ULX5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF112Q9ULX5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF112Q9ULX5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF112Q9ULX5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF112Q9ULX5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF112Q9ULX5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF112Q9ULX5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF112Q9ULX5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF112Q9ULX5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF112Q9ULX5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF112Q9ULX5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF112Q9ULX5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF112Q9ULX5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF112Q9ULX5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF112Q9ULX5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF112Q9ULX5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF112Q9ULX5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF112Q9ULX5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF112Q9ULX5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF112Q9ULX5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF112Q9ULX5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF112Q9ULX5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF112Q9ULX5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF112Q9ULX5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF112Q9ULX5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF112Q9ULX5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF112Q9ULX5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF112Q9ULX5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF112Q9ULX5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF112Q9ULX5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF112Q9ULX5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF112Q9ULX5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF112Q9ULX5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF112Q9ULX5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF112Q9ULX5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF112Q9ULX5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF112Q9ULX5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF112Q9ULX5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF112Q9ULX5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF112Q9ULX5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF112Q9ULX5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF112Q9ULX5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF112Q9ULX5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF112Q9ULX5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF112Q9ULX5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF112Q9ULX5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF112Q9ULX5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF112Q9ULX5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF112Q9ULX5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF112Q9ULX5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF112Q9ULX5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF112Q9ULX5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF112Q9ULX5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF112Q9ULX5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF112Q9ULX5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms