Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYTH4Q9UIA0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYTH4Q9UIA0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYTH4Q9UIA0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYTH4Q9UIA0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYTH4Q9UIA0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYTH4Q9UIA0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYTH4Q9UIA0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYTH4Q9UIA0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYTH4Q9UIA0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CYTH4Q9UIA0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYTH4Q9UIA0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYTH4Q9UIA0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYTH4Q9UIA0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CYTH4Q9UIA0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CYTH4Q9UIA0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CYTH4Q9UIA0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CYTH4Q9UIA0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CYTH4Q9UIA0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CYTH4Q9UIA0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CYTH4Q9UIA0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CYTH4Q9UIA0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CYTH4Q9UIA0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CYTH4Q9UIA0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CYTH4Q9UIA0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CYTH4Q9UIA0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CYTH4Q9UIA0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CYTH4Q9UIA0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYTH4Q9UIA0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYTH4Q9UIA0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYTH4Q9UIA0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYTH4Q9UIA0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYTH4Q9UIA0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYTH4Q9UIA0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYTH4Q9UIA0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYTH4Q9UIA0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYTH4Q9UIA0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYTH4Q9UIA0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CYTH4Q9UIA0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CYTH4Q9UIA0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYTH4Q9UIA0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYTH4Q9UIA0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYTH4Q9UIA0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYTH4Q9UIA0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CYTH4Q9UIA0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYTH4Q9UIA0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYTH4Q9UIA0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYTH4Q9UIA0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYTH4Q9UIA0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CYTH4Q9UIA0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CYTH4Q9UIA0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CYTH4Q9UIA0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CYTH4Q9UIA0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CYTH4Q9UIA0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CYTH4Q9UIA0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CYTH4Q9UIA0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CYTH4Q9UIA0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CYTH4Q9UIA0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CYTH4Q9UIA0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CYTH4Q9UIA0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CYTH4Q9UIA0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CYTH4Q9UIA0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CYTH4Q9UIA0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CYTH4Q9UIA0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CYTH4Q9UIA0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYTH4Q9UIA0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYTH4Q9UIA0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYTH4Q9UIA0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYTH4Q9UIA0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYTH4Q9UIA0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYTH4Q9UIA0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYTH4Q9UIA0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYTH4Q9UIA0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYTH4Q9UIA0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYTH4Q9UIA0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYTH4Q9UIA0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CYTH4Q9UIA0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYTH4Q9UIA0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYTH4Q9UIA0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CYTH4Q9UIA0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CYTH4Q9UIA0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CYTH4Q9UIA0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CYTH4Q9UIA0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CYTH4Q9UIA0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CYTH4Q9UIA0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CYTH4Q9UIA0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CYTH4Q9UIA0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CYTH4Q9UIA0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYTH4Q9UIA0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYTH4Q9UIA0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CYTH4Q9UIA0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CYTH4Q9UIA0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CYTH4Q9UIA0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CYTH4Q9UIA0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CYTH4Q9UIA0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CYTH4Q9UIA0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CYTH4Q9UIA0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CYTH4Q9UIA0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CYTH4Q9UIA0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CYTH4Q9UIA0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms