Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PUF60Q9UHX1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PUF60Q9UHX1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PUF60Q9UHX1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PUF60Q9UHX1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PUF60Q9UHX1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PUF60Q9UHX1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PUF60Q9UHX1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PUF60Q9UHX1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PUF60Q9UHX1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PUF60Q9UHX1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PUF60Q9UHX1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PUF60Q9UHX1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PUF60Q9UHX1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PUF60Q9UHX1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PUF60Q9UHX1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PUF60Q9UHX1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PUF60Q9UHX1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PUF60Q9UHX1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PUF60Q9UHX1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PUF60Q9UHX1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PUF60Q9UHX1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PUF60Q9UHX1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PUF60Q9UHX1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PUF60Q9UHX1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PUF60Q9UHX1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PUF60Q9UHX1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PUF60Q9UHX1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PUF60Q9UHX1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PUF60Q9UHX1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PUF60Q9UHX1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PUF60Q9UHX1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PUF60Q9UHX1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PUF60Q9UHX1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PUF60Q9UHX1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PUF60Q9UHX1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PUF60Q9UHX1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PUF60Q9UHX1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PUF60Q9UHX1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PUF60Q9UHX1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PUF60Q9UHX1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PUF60Q9UHX1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PUF60Q9UHX1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PUF60Q9UHX1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PUF60Q9UHX1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PUF60Q9UHX1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PUF60Q9UHX1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PUF60Q9UHX1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PUF60Q9UHX1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PUF60Q9UHX1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PUF60Q9UHX1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PUF60Q9UHX1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PUF60Q9UHX1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PUF60Q9UHX1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PUF60Q9UHX1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PUF60Q9UHX1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PUF60Q9UHX1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PUF60Q9UHX1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PUF60Q9UHX1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PUF60Q9UHX1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PUF60Q9UHX1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PUF60Q9UHX1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PUF60Q9UHX1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PUF60Q9UHX1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PUF60Q9UHX1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PUF60Q9UHX1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PUF60Q9UHX1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PUF60Q9UHX1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PUF60Q9UHX1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PUF60Q9UHX1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PUF60Q9UHX1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PUF60Q9UHX1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PUF60Q9UHX1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PUF60Q9UHX1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PUF60Q9UHX1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PUF60Q9UHX1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PUF60Q9UHX1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PUF60Q9UHX1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PUF60Q9UHX1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PUF60Q9UHX1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PUF60Q9UHX1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PUF60Q9UHX1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PUF60Q9UHX1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PUF60Q9UHX1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PUF60Q9UHX1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PUF60Q9UHX1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PUF60Q9UHX1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PUF60Q9UHX1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PUF60Q9UHX1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PUF60Q9UHX1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PUF60Q9UHX1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PUF60Q9UHX1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
PUF60Q9UHX1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PUF60Q9UHX1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PUF60Q9UHX1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PUF60Q9UHX1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PUF60Q9UHX1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PUF60Q9UHX1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PUF60Q9UHX1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PUF60Q9UHX1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms