Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI7

SLC23A1, Solute carrier family 23 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC23A1Q9UHI7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC23A1Q9UHI7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC23A1Q9UHI7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC23A1Q9UHI7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC23A1Q9UHI7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC23A1Q9UHI7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC23A1Q9UHI7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC23A1Q9UHI7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC23A1Q9UHI7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC23A1Q9UHI7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC23A1Q9UHI7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC23A1Q9UHI7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC23A1Q9UHI7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC23A1Q9UHI7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC23A1Q9UHI7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC23A1Q9UHI7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC23A1Q9UHI7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC23A1Q9UHI7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC23A1Q9UHI7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC23A1Q9UHI7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC23A1Q9UHI7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC23A1Q9UHI7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC23A1Q9UHI7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC23A1Q9UHI7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC23A1Q9UHI7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC23A1Q9UHI7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC23A1Q9UHI7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC23A1Q9UHI7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC23A1Q9UHI7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC23A1Q9UHI7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC23A1Q9UHI7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC23A1Q9UHI7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC23A1Q9UHI7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC23A1Q9UHI7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC23A1Q9UHI7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC23A1Q9UHI7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC23A1Q9UHI7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC23A1Q9UHI7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC23A1Q9UHI7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC23A1Q9UHI7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC23A1Q9UHI7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC23A1Q9UHI7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC23A1Q9UHI7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC23A1Q9UHI7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC23A1Q9UHI7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC23A1Q9UHI7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC23A1Q9UHI7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC23A1Q9UHI7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC23A1Q9UHI7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC23A1Q9UHI7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC23A1Q9UHI7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC23A1Q9UHI7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC23A1Q9UHI7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC23A1Q9UHI7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC23A1Q9UHI7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC23A1Q9UHI7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC23A1Q9UHI7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC23A1Q9UHI7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC23A1Q9UHI7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC23A1Q9UHI7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC23A1Q9UHI7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC23A1Q9UHI7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC23A1Q9UHI7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC23A1Q9UHI7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC23A1Q9UHI7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC23A1Q9UHI7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC23A1Q9UHI7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC23A1Q9UHI7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC23A1Q9UHI7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC23A1Q9UHI7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC23A1Q9UHI7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC23A1Q9UHI7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC23A1Q9UHI7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC23A1Q9UHI7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC23A1Q9UHI7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC23A1Q9UHI7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC23A1Q9UHI7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC23A1Q9UHI7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC23A1Q9UHI7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC23A1Q9UHI7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC23A1Q9UHI7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC23A1Q9UHI7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC23A1Q9UHI7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC23A1Q9UHI7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC23A1Q9UHI7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC23A1Q9UHI7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC23A1Q9UHI7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC23A1Q9UHI7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC23A1Q9UHI7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC23A1Q9UHI7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SLC23A1Q9UHI7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC23A1Q9UHI7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC23A1Q9UHI7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC23A1Q9UHI7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC23A1Q9UHI7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC23A1Q9UHI7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC23A1Q9UHI7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC23A1Q9UHI7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC23A1Q9UHI7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC23A1Q9UHI7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms