Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
KDM5BQ9UGL1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
KDM5BQ9UGL1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
KDM5BQ9UGL1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC39.84■■■■□ 3.97
KDM5BQ9UGL1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
KDM5BQ9UGL1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
KDM5BQ9UGL1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
KDM5BQ9UGL1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC39.82■■■■□ 3.96
KDM5BQ9UGL1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.96
KDM5BQ9UGL1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
KDM5BQ9UGL1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
KDM5BQ9UGL1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
KDM5BQ9UGL1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
KDM5BQ9UGL1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
KDM5BQ9UGL1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
KDM5BQ9UGL1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.78■■■■□ 3.96
KDM5BQ9UGL1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC39.78■■■■□ 3.96
KDM5BQ9UGL1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC39.77■■■■□ 3.96
KDM5BQ9UGL1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC39.77■■■■□ 3.96
KDM5BQ9UGL1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC39.76■■■■□ 3.96
KDM5BQ9UGL1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC39.76■■■■□ 3.96
KDM5BQ9UGL1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC39.75■■■■□ 3.95
KDM5BQ9UGL1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
KDM5BQ9UGL1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC39.75■■■■□ 3.95
KDM5BQ9UGL1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC39.74■■■■□ 3.95
KDM5BQ9UGL1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
KDM5BQ9UGL1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
KDM5BQ9UGL1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.73■■■■□ 3.95
KDM5BQ9UGL1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
KDM5BQ9UGL1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
KDM5BQ9UGL1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
KDM5BQ9UGL1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
KDM5BQ9UGL1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC39.72■■■■□ 3.95
KDM5BQ9UGL1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC39.72■■■■□ 3.95
KDM5BQ9UGL1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
KDM5BQ9UGL1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
KDM5BQ9UGL1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
KDM5BQ9UGL1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
KDM5BQ9UGL1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
KDM5BQ9UGL1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
KDM5BQ9UGL1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
KDM5BQ9UGL1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
KDM5BQ9UGL1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
KDM5BQ9UGL1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.69■■■■□ 3.94
KDM5BQ9UGL1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC39.69■■■■□ 3.94
KDM5BQ9UGL1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
KDM5BQ9UGL1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
KDM5BQ9UGL1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
KDM5BQ9UGL1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
KDM5BQ9UGL1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC39.67■■■■□ 3.94
KDM5BQ9UGL1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
KDM5BQ9UGL1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC39.66■■■■□ 3.94
KDM5BQ9UGL1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.66■■■■□ 3.94
KDM5BQ9UGL1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC39.66■■■■□ 3.94
KDM5BQ9UGL1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.65■■■■□ 3.94
KDM5BQ9UGL1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
KDM5BQ9UGL1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC39.65■■■■□ 3.94
KDM5BQ9UGL1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.64■■■■□ 3.94
KDM5BQ9UGL1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
KDM5BQ9UGL1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC39.64■■■■□ 3.94
KDM5BQ9UGL1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC39.64■■■■□ 3.94
KDM5BQ9UGL1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC39.64■■■■□ 3.94
KDM5BQ9UGL1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.64■■■■□ 3.94
KDM5BQ9UGL1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
KDM5BQ9UGL1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.94
KDM5BQ9UGL1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC39.63■■■■□ 3.93
KDM5BQ9UGL1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
KDM5BQ9UGL1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
KDM5BQ9UGL1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
KDM5BQ9UGL1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC39.61■■■■□ 3.93
KDM5BQ9UGL1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
KDM5BQ9UGL1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC39.6■■■■□ 3.93
KDM5BQ9UGL1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC39.6■■■■□ 3.93
KDM5BQ9UGL1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
KDM5BQ9UGL1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
KDM5BQ9UGL1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
KDM5BQ9UGL1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.58■■■■□ 3.93
KDM5BQ9UGL1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC39.58■■■■□ 3.93
KDM5BQ9UGL1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
KDM5BQ9UGL1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
KDM5BQ9UGL1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC39.57■■■■□ 3.93
KDM5BQ9UGL1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
KDM5BQ9UGL1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC39.56■■■■□ 3.92
KDM5BQ9UGL1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
KDM5BQ9UGL1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
KDM5BQ9UGL1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC39.55■■■■□ 3.92
KDM5BQ9UGL1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
KDM5BQ9UGL1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
KDM5BQ9UGL1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
KDM5BQ9UGL1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC39.55■■■■□ 3.92
KDM5BQ9UGL1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
KDM5BQ9UGL1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
KDM5BQ9UGL1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC39.54■■■■□ 3.92
KDM5BQ9UGL1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC39.54■■■■□ 3.92
KDM5BQ9UGL1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
KDM5BQ9UGL1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC39.53■■■■□ 3.92
KDM5BQ9UGL1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
KDM5BQ9UGL1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC39.53■■■■□ 3.92
KDM5BQ9UGL1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
KDM5BQ9UGL1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms