Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U1

ACTR3B, Actin-related protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3BQ9P1U1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTR3BQ9P1U1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTR3BQ9P1U1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTR3BQ9P1U1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTR3BQ9P1U1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ACTR3BQ9P1U1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTR3BQ9P1U1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTR3BQ9P1U1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTR3BQ9P1U1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTR3BQ9P1U1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTR3BQ9P1U1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTR3BQ9P1U1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTR3BQ9P1U1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTR3BQ9P1U1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTR3BQ9P1U1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTR3BQ9P1U1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTR3BQ9P1U1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTR3BQ9P1U1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTR3BQ9P1U1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTR3BQ9P1U1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTR3BQ9P1U1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTR3BQ9P1U1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTR3BQ9P1U1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTR3BQ9P1U1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTR3BQ9P1U1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTR3BQ9P1U1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTR3BQ9P1U1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTR3BQ9P1U1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTR3BQ9P1U1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTR3BQ9P1U1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTR3BQ9P1U1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTR3BQ9P1U1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTR3BQ9P1U1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTR3BQ9P1U1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACTR3BQ9P1U1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACTR3BQ9P1U1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACTR3BQ9P1U1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACTR3BQ9P1U1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACTR3BQ9P1U1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACTR3BQ9P1U1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACTR3BQ9P1U1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACTR3BQ9P1U1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACTR3BQ9P1U1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTR3BQ9P1U1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTR3BQ9P1U1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTR3BQ9P1U1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTR3BQ9P1U1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTR3BQ9P1U1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTR3BQ9P1U1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTR3BQ9P1U1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTR3BQ9P1U1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTR3BQ9P1U1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTR3BQ9P1U1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTR3BQ9P1U1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTR3BQ9P1U1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTR3BQ9P1U1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTR3BQ9P1U1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTR3BQ9P1U1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTR3BQ9P1U1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTR3BQ9P1U1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTR3BQ9P1U1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTR3BQ9P1U1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTR3BQ9P1U1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTR3BQ9P1U1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTR3BQ9P1U1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTR3BQ9P1U1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTR3BQ9P1U1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACTR3BQ9P1U1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACTR3BQ9P1U1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTR3BQ9P1U1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTR3BQ9P1U1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTR3BQ9P1U1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTR3BQ9P1U1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTR3BQ9P1U1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTR3BQ9P1U1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTR3BQ9P1U1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTR3BQ9P1U1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTR3BQ9P1U1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTR3BQ9P1U1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTR3BQ9P1U1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTR3BQ9P1U1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTR3BQ9P1U1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTR3BQ9P1U1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTR3BQ9P1U1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTR3BQ9P1U1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTR3BQ9P1U1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTR3BQ9P1U1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTR3BQ9P1U1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTR3BQ9P1U1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTR3BQ9P1U1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTR3BQ9P1U1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTR3BQ9P1U1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTR3BQ9P1U1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTR3BQ9P1U1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTR3BQ9P1U1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTR3BQ9P1U1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTR3BQ9P1U1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTR3BQ9P1U1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTR3BQ9P1U1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTR3BQ9P1U1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms