Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VAPAQ9P0L0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VAPAQ9P0L0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
VAPAQ9P0L0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VAPAQ9P0L0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VAPAQ9P0L0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VAPAQ9P0L0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
VAPAQ9P0L0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VAPAQ9P0L0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAPAQ9P0L0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAPAQ9P0L0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAPAQ9P0L0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
VAPAQ9P0L0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAPAQ9P0L0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAPAQ9P0L0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAPAQ9P0L0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAPAQ9P0L0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAPAQ9P0L0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAPAQ9P0L0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAPAQ9P0L0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAPAQ9P0L0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAPAQ9P0L0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAPAQ9P0L0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAPAQ9P0L0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAPAQ9P0L0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAPAQ9P0L0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAPAQ9P0L0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAPAQ9P0L0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAPAQ9P0L0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAPAQ9P0L0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAPAQ9P0L0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAPAQ9P0L0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAPAQ9P0L0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAPAQ9P0L0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
VAPAQ9P0L0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAPAQ9P0L0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAPAQ9P0L0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAPAQ9P0L0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAPAQ9P0L0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAPAQ9P0L0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAPAQ9P0L0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
VAPAQ9P0L0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAPAQ9P0L0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAPAQ9P0L0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAPAQ9P0L0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAPAQ9P0L0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VAPAQ9P0L0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VAPAQ9P0L0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VAPAQ9P0L0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VAPAQ9P0L0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VAPAQ9P0L0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VAPAQ9P0L0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
VAPAQ9P0L0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VAPAQ9P0L0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
VAPAQ9P0L0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VAPAQ9P0L0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
VAPAQ9P0L0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VAPAQ9P0L0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VAPAQ9P0L0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VAPAQ9P0L0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VAPAQ9P0L0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VAPAQ9P0L0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VAPAQ9P0L0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VAPAQ9P0L0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VAPAQ9P0L0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VAPAQ9P0L0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VAPAQ9P0L0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VAPAQ9P0L0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VAPAQ9P0L0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VAPAQ9P0L0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VAPAQ9P0L0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAPAQ9P0L0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAPAQ9P0L0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAPAQ9P0L0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAPAQ9P0L0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAPAQ9P0L0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAPAQ9P0L0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAPAQ9P0L0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAPAQ9P0L0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAPAQ9P0L0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAPAQ9P0L0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAPAQ9P0L0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAPAQ9P0L0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
VAPAQ9P0L0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAPAQ9P0L0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAPAQ9P0L0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAPAQ9P0L0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAPAQ9P0L0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAPAQ9P0L0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VAPAQ9P0L0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VAPAQ9P0L0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VAPAQ9P0L0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VAPAQ9P0L0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VAPAQ9P0L0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VAPAQ9P0L0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VAPAQ9P0L0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VAPAQ9P0L0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VAPAQ9P0L0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VAPAQ9P0L0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VAPAQ9P0L0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms