Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0I2

EMC3, ER membrane protein complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC3Q9P0I2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EMC3Q9P0I2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EMC3Q9P0I2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EMC3Q9P0I2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EMC3Q9P0I2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EMC3Q9P0I2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMC3Q9P0I2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMC3Q9P0I2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMC3Q9P0I2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMC3Q9P0I2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EMC3Q9P0I2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EMC3Q9P0I2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EMC3Q9P0I2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EMC3Q9P0I2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
EMC3Q9P0I2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EMC3Q9P0I2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EMC3Q9P0I2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EMC3Q9P0I2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EMC3Q9P0I2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EMC3Q9P0I2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EMC3Q9P0I2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EMC3Q9P0I2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EMC3Q9P0I2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EMC3Q9P0I2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EMC3Q9P0I2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EMC3Q9P0I2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EMC3Q9P0I2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EMC3Q9P0I2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EMC3Q9P0I2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EMC3Q9P0I2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EMC3Q9P0I2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EMC3Q9P0I2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EMC3Q9P0I2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EMC3Q9P0I2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EMC3Q9P0I2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EMC3Q9P0I2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMC3Q9P0I2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMC3Q9P0I2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMC3Q9P0I2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMC3Q9P0I2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMC3Q9P0I2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMC3Q9P0I2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMC3Q9P0I2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMC3Q9P0I2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMC3Q9P0I2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMC3Q9P0I2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EMC3Q9P0I2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EMC3Q9P0I2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EMC3Q9P0I2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMC3Q9P0I2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMC3Q9P0I2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMC3Q9P0I2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMC3Q9P0I2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMC3Q9P0I2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMC3Q9P0I2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMC3Q9P0I2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMC3Q9P0I2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMC3Q9P0I2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMC3Q9P0I2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EMC3Q9P0I2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EMC3Q9P0I2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EMC3Q9P0I2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EMC3Q9P0I2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EMC3Q9P0I2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EMC3Q9P0I2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMC3Q9P0I2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMC3Q9P0I2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMC3Q9P0I2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMC3Q9P0I2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EMC3Q9P0I2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMC3Q9P0I2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMC3Q9P0I2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMC3Q9P0I2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMC3Q9P0I2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMC3Q9P0I2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMC3Q9P0I2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMC3Q9P0I2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMC3Q9P0I2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMC3Q9P0I2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMC3Q9P0I2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMC3Q9P0I2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMC3Q9P0I2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMC3Q9P0I2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMC3Q9P0I2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMC3Q9P0I2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMC3Q9P0I2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMC3Q9P0I2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMC3Q9P0I2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMC3Q9P0I2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMC3Q9P0I2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMC3Q9P0I2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMC3Q9P0I2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMC3Q9P0I2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMC3Q9P0I2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMC3Q9P0I2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMC3Q9P0I2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMC3Q9P0I2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMC3Q9P0I2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMC3Q9P0I2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMC3Q9P0I2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms