Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX58

LYAR, Cell growth-regulating nucleolar protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYARQ9NX58 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LYARQ9NX58 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LYARQ9NX58 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LYARQ9NX58 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LYARQ9NX58 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LYARQ9NX58 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LYARQ9NX58 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LYARQ9NX58 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LYARQ9NX58 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LYARQ9NX58 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LYARQ9NX58 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LYARQ9NX58 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LYARQ9NX58 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LYARQ9NX58 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LYARQ9NX58 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LYARQ9NX58 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LYARQ9NX58 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LYARQ9NX58 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LYARQ9NX58 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LYARQ9NX58 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LYARQ9NX58 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LYARQ9NX58 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LYARQ9NX58 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LYARQ9NX58 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LYARQ9NX58 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LYARQ9NX58 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LYARQ9NX58 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LYARQ9NX58 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LYARQ9NX58 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LYARQ9NX58 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LYARQ9NX58 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LYARQ9NX58 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LYARQ9NX58 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LYARQ9NX58 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LYARQ9NX58 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LYARQ9NX58 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LYARQ9NX58 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LYARQ9NX58 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LYARQ9NX58 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LYARQ9NX58 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LYARQ9NX58 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LYARQ9NX58 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LYARQ9NX58 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LYARQ9NX58 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LYARQ9NX58 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LYARQ9NX58 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LYARQ9NX58 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LYARQ9NX58 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LYARQ9NX58 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LYARQ9NX58 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LYARQ9NX58 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LYARQ9NX58 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LYARQ9NX58 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LYARQ9NX58 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LYARQ9NX58 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LYARQ9NX58 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LYARQ9NX58 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LYARQ9NX58 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LYARQ9NX58 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LYARQ9NX58 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LYARQ9NX58 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LYARQ9NX58 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LYARQ9NX58 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LYARQ9NX58 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LYARQ9NX58 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LYARQ9NX58 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LYARQ9NX58 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LYARQ9NX58 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LYARQ9NX58 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LYARQ9NX58 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LYARQ9NX58 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LYARQ9NX58 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LYARQ9NX58 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LYARQ9NX58 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LYARQ9NX58 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LYARQ9NX58 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LYARQ9NX58 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LYARQ9NX58 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LYARQ9NX58 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LYARQ9NX58 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LYARQ9NX58 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LYARQ9NX58 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LYARQ9NX58 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LYARQ9NX58 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LYARQ9NX58 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LYARQ9NX58 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LYARQ9NX58 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LYARQ9NX58 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LYARQ9NX58 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LYARQ9NX58 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LYARQ9NX58 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LYARQ9NX58 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LYARQ9NX58 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LYARQ9NX58 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LYARQ9NX58 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LYARQ9NX58 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LYARQ9NX58 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LYARQ9NX58 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LYARQ9NX58 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LYARQ9NX58 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms