Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWT1

PAK1IP1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAK1IP1Q9NWT1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAK1IP1Q9NWT1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAK1IP1Q9NWT1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAK1IP1Q9NWT1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAK1IP1Q9NWT1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PAK1IP1Q9NWT1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PAK1IP1Q9NWT1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PAK1IP1Q9NWT1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAK1IP1Q9NWT1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAK1IP1Q9NWT1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAK1IP1Q9NWT1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAK1IP1Q9NWT1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAK1IP1Q9NWT1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAK1IP1Q9NWT1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAK1IP1Q9NWT1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAK1IP1Q9NWT1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAK1IP1Q9NWT1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAK1IP1Q9NWT1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAK1IP1Q9NWT1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAK1IP1Q9NWT1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAK1IP1Q9NWT1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAK1IP1Q9NWT1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAK1IP1Q9NWT1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAK1IP1Q9NWT1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAK1IP1Q9NWT1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAK1IP1Q9NWT1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PAK1IP1Q9NWT1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAK1IP1Q9NWT1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAK1IP1Q9NWT1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAK1IP1Q9NWT1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAK1IP1Q9NWT1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAK1IP1Q9NWT1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAK1IP1Q9NWT1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAK1IP1Q9NWT1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAK1IP1Q9NWT1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAK1IP1Q9NWT1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAK1IP1Q9NWT1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PAK1IP1Q9NWT1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PAK1IP1Q9NWT1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PAK1IP1Q9NWT1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAK1IP1Q9NWT1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAK1IP1Q9NWT1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAK1IP1Q9NWT1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAK1IP1Q9NWT1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAK1IP1Q9NWT1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAK1IP1Q9NWT1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAK1IP1Q9NWT1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAK1IP1Q9NWT1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAK1IP1Q9NWT1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAK1IP1Q9NWT1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAK1IP1Q9NWT1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAK1IP1Q9NWT1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAK1IP1Q9NWT1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAK1IP1Q9NWT1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAK1IP1Q9NWT1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAK1IP1Q9NWT1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAK1IP1Q9NWT1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAK1IP1Q9NWT1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAK1IP1Q9NWT1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAK1IP1Q9NWT1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAK1IP1Q9NWT1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAK1IP1Q9NWT1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAK1IP1Q9NWT1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAK1IP1Q9NWT1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAK1IP1Q9NWT1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAK1IP1Q9NWT1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAK1IP1Q9NWT1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAK1IP1Q9NWT1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAK1IP1Q9NWT1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAK1IP1Q9NWT1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAK1IP1Q9NWT1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAK1IP1Q9NWT1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAK1IP1Q9NWT1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAK1IP1Q9NWT1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAK1IP1Q9NWT1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PAK1IP1Q9NWT1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAK1IP1Q9NWT1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAK1IP1Q9NWT1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAK1IP1Q9NWT1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PAK1IP1Q9NWT1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAK1IP1Q9NWT1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAK1IP1Q9NWT1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAK1IP1Q9NWT1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAK1IP1Q9NWT1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAK1IP1Q9NWT1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAK1IP1Q9NWT1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAK1IP1Q9NWT1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAK1IP1Q9NWT1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAK1IP1Q9NWT1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAK1IP1Q9NWT1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAK1IP1Q9NWT1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAK1IP1Q9NWT1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAK1IP1Q9NWT1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAK1IP1Q9NWT1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAK1IP1Q9NWT1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAK1IP1Q9NWT1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAK1IP1Q9NWT1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAK1IP1Q9NWT1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAK1IP1Q9NWT1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAK1IP1Q9NWT1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms